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山西医科大学晋祠学院始建于2002年，是经教育部、山西省人民政府批准设立的全日制普通本科高校，也是山西省唯一的一所以医学专业为主的独立学院。
学院坐落在具有2500年悠久历史的文化名城太原，校园占地面积330亩，绿化面积达40%以上，园林式的校园风景秀丽、绿荫环抱、碧草如茵、清静幽雅，是读书治学的理想之地。学院立足山西、面向全国部分省、市、自治区招生，重点培养学生创新、实践能力，以培养“复合型、应用型、技术型”医学人才为特色，建院以来为社会培养医药卫生专业人才近万名。
2002年6月，经山西省人民政府批准，（晋政函［2002］118号）山西医科大学晋祠学院成立，为山西医科大学二级学院。2003年，学院首次招录医学类本科生。2004年3月，被国家教育部确认为独立学院（教发函［2004］42号），是山西省唯一一所医学类独立学院，具有独立法人、独立校园、独立财务、独立颁发文凭资格。2003年至2005年，先后开设了临床医学、预防医学、麻醉学、法医学、口腔医学、药学、影像学、护理学、信息管理与信息系统、社会工作、公共事业管理、中药学、药物制剂、英语等14个专业。2006年起，学院对所招学生进行全程培养管理，专业设置主要有临床医学、护理学、口腔医学、信息管理与信息系统、社会工作、公共事业管理等6个专业。学院依托山西医科大学雄厚的师资力量，所有的医学专业教学课程由山西医科大学教务处安排并组织实施。2009年，学院先后成立了自已的基础课教研室和体育课教研室，分别担负学院学生的英语课和体育课教学任务。
2014年，我院在新一届领导班子带领下厚积薄发，学院现设有四系一部，分别为临床医学系、口腔医学系、护理学系、预防与管理学系和基础医部，开设临床医学、口腔医学、麻醉学、护理学、预防医学、医学影像技术、医学检验技术、康复治疗学八个本科专业。涵盖医学、理学两个学科门类。
学院现有主讲教师439人，其中教授91人，副教授158人，讲师149人，助教41人，副教授以上职称教师占到56%，高素质、专家型的教师队伍为保障教学质量奠定了坚实的基础。学院拥有门类齐全、设施配套的医学基础实验室、医学临床实验室、口腔实验室、护理实验室等，教学仪器设备总值一千余万元，图书馆藏书38万余册。 学院注重课堂教学与临床实践的紧密结合，大力培养学生扎实的实践动手能力，先后在山西、北京、天津等地建立了42所教学实习医院，为学生临床实习、见习教学以及毕业后的就业创造了优越的条件。近期学院将筹建附属医院，服务社会，满足教学，真正实现医教结合，双赢发展。
学院根据国家“十二五”中长期教育发展规划，在进一步优化临床医学品牌专业的基础上，为临床医学专业的学生开拓意大利、美国等国外硕博连读升学渠道；力争把护理学专业也创建为具有较强办学实力，特色鲜明的品牌专业，并为护理专业的学生开创国外实习、就业的渠道。以临床医学和护理学专业为龙头，把山西省唯一的医学影像技术专业办出特色、办成重点，带动其他专业协调发展。
自2010年以来学院毕业生考研率逐年上升，分别考取北京协和医院、首都医科大学、第二军医大学、浙江大学医学部、大连医科大学等全国一流的医学高校和科研单位；毕业生就业率保持在90%左右，特别是护理学专业的毕业生就业率达到95%以上，受到社会、特别是基层医疗单位的好评。
山西医科大学晋祠学院将继续秉持“以质量求生存、以特色求发展”的办学理念，全面加强内涵建设，进一步解放思想、深化改革、加强管理、狠抓落实，努力把学院建设成结构合理、质量上乘、特色鲜明的大学。